数据集概述
本数据集为噬菌体深度突变扫描研究短线性基序(SLiM)结合决定因素的原始数据,包含6个文件,用于基准测试已知SLiM肽相互作用体的方法性能,涉及PSSM表、JSON对比数据及压缩包等,支持域-肽互作系统中SLiM的识别与扩展研究。
文件详解
- README.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:补充材料说明文档,包含研究作者、 affiliations等信息
- generate_final_PSSMs_table.tar.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:生成最终PSSM表的压缩包文件
- DMS-BM_vs_ELM.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:DMS基准测试与ELM数据对比的JSON格式数据文件
- DMS-BM_vs_itself.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:DMS基准测试自身对比的JSON格式数据文件
- ELM_PSSMs.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:ELM相关PSSM数据的JSON格式文件
- DMS-BM_PSSMs.tar.gz
- 文件格式:GZ
- 字段映射介绍:DMS基准测试PSSM数据的压缩包文件
数据来源
论文“Defining short linear motif binding determinants by phage-based deep mutational scanning”
适用场景
- 生物信息学研究: 分析短线性基序(SLiM)在域-肽互作系统中的结合决定因素
- 基因序列分析: 基于PSSM数据识别和扩展新的SLiM序列
- 分子生物学方法验证: 基准测试噬菌体展示结合深度突变扫描的SLiM研究方法
- 蛋白质互作机制研究: 探索蛋白质结构域与肽段相互作用的分子机制
- 生物数据整合分析: 结合JSON格式对比数据开展跨数据集的SLiM特征比较