数据集概述
本数据集为研究剪接调控因子PTBP2在神经元成熟中的作用提供实验数据支撑，包含转录组分析、基因本体分析等相关补充文件，记录PTBP2缺失对小鼠皮层发育及神经元成熟的影响，涉及剪接事件、基因表达变化及功能注释等内容。
文件详解
- 数据文件（.xls格式，共7个）
- Supplemental File 6 Table_S6_gene_ontology_2_fold_upregulated transcripts_v2.xls：2倍上调转录本的基因本体分析表
- Supplemental File 2 Table_S2_MJAY Array_top_Splicing_events_by_SepScore.xls：基于SepScore的主要剪接事件表
- Supplemental File 3 Table S3_nestin_nptbko_SpliceTrap_psi_over10percent_with_pvalues.xls：Nestin-PTBP2敲除样本中PSI值变化超10%的剪接事件表（含p值）
- Supplemental File 8 Table_S8_Emx_P1_SpliceTrap_psi_over10percent_with_pvalues.xls：Emx-P1样本中PSI值变化超10%的剪接事件表（含p值）
- Supplemental File 7 Table_S7_gene_ontology_2_fold_change_down_regulated_transcripts_v2.xls：2倍下调转录本的基因本体分析表
- Supplemental File 5 Table_S5_cuffdiff_NesKOvWT_expression_change_V3.xls：Nestin敲除与野生型样本的基因表达变化表（Cuffdiff分析）
- Supplemental File 4 Table_S4_GO_analysis_nestin_splicetrap_exons.xls：Nestin剪接捕获外显子的基因本体分析表
- 文档文件（.docx格式，共1个）
- Supplemental File 1 Table S1 RT-PCR validated E18 exons.docx：E18时期经RT-PCR验证的外显子表
数据来源
论文“The splicing regulator PTBP2 controls a program of embryonic splicing required for neuronal maturation”
适用场景
- 神经元发育调控研究：分析PTBP2对胚胎剪接程序及神经元成熟的调控机制
- 基因剪接事件分析：探究小鼠皮层发育中关键剪接事件的变化及功能影响
- 基因表达差异研究：对比PTBP2缺失与野生型样本的基因表达变化规律
- 神经生物学实验验证：支撑神经元成熟相关剪接事件及基因功能的实验验证工作
