数据集概述
本数据集为PTMoreR研究的补充表格,包含6个Excel文件(Table S2-S7),覆盖人类与小鼠磷酸化位点、129种哺乳动物信息、跨物种磷酸化位点可检测性矩阵、GO富集分析、激酶富集分析及10种常见哺乳动物磷酸化表达数据,支持跨物种翻译后修饰(PTM)映射与比较磷酸化蛋白质组学研究。
文件详解
- Table S2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:含两个工作表“Human.identified”和“Mouse.identified”,分别记录人类(115,179个)和小鼠(42,997个)磷酸化位点数据。
- Table S3.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录从UniProt下载的129种哺乳动物的信息及物种标识。
- Table S4.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:列1-3为UniProt ID、残基、磷酸化位点位置;列4-17为磷酸化蛋白质组特征(用于相关图表分析);列18-146为跨物种可检测性矩阵(0=未映射,1=已映射,窗口相似度≥8)。
- Table S5.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录GO富集分析中BH校正P值0.05(其他四段)的GO术语。
- Table S6.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录各Q1-Q5分段中激酶富集分析BH校正P值<0.01的结果。
- Table S7.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录10种常见哺乳动物(真兽亚纲下两个分支)的磷酸化表达数据及统计结果。
数据来源
论文“PTMoreR: a motif-centric analysis enabling cross-species PTM mapping and comparative phosphoproteomics across mammals”
适用场景
- 跨物种PTM映射研究: 利用磷酸化位点数据及可检测性矩阵,分析不同哺乳动物间翻译后修饰的保守性与差异。
- 比较磷酸化蛋白质组学分析: 基于多物种磷酸化表达数据,探究磷酸化修饰的进化特征。
- 功能基因组学研究: 通过GO富集分析结果,关联磷酸化蛋白质的生物学功能。
- 激酶调控机制分析: 利用激酶富集分析数据,研究激酶对磷酸化位点的调控模式。
- 哺乳动物磷酸化数据库构建: 整合多物种磷酸化位点及物种信息,支持相关数据库补充与完善。