PTP酶qFit多构象模型RINFAIRE网络分析补充材料

数据集概述

本数据集为论文《从晶体学多构象模型集合绘制相关蛋白质结构中的变构重连》的补充材料,包含PTP酶qFit多构象模型的RINFAIRE网络分析相关文件,支持复现研究中的数据分析过程。

文件详解

  • README.md:Markdown格式说明文档,介绍数据集背景、关联论文及使用指引
  • PTPs_Metadata.csv:CSV格式元数据文件,包含PDB ID、晶胞参数、分辨率、空间群、来源生物等蛋白质结构相关信息
  • All_PTPs_MultiNetwork.pkl:Python pickle格式文件,存储PTP酶多构象模型的网络数据
  • ResiduesOfInterest_Fig6.csv:CSV格式文件,包含论文图6相关的关键残基数据,如影响性突变、实验验证突变、不同区域残基数等
  • PROMALS3D_PTPsAlignment.fa:FASTA格式文件,存储PTP酶序列的PROMALS3D比对结果
  • qFit_Models_CatDom.zip:压缩文件,包含PTP酶催化结构域的qFit多构象模型文件
  • All_PTPs_SumNetwork_Degree+Edges.xlsx:Excel格式文件,包含PTP酶汇总网络的节点度和边数据
  • All_PTPs_SumNetwork.pkl:Python pickle格式文件,存储PTP酶汇总网络数据
  • qFit_Models_FullStruct.zip:压缩文件,包含PTP酶完整结构的qFit多构象模型文件

适用场景

  • 蛋白质结构生物学研究:分析PTP酶多构象模型的网络特征与变构机制
  • 计算生物学分析:复现RINFAIRE网络分析方法在蛋白质构象研究中的应用
  • 酶学机制研究:探究PTP酶关键残基突变与功能的关联
  • 结构生物学数据挖掘:基于元数据和网络数据挖掘蛋白质结构-功能关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 326.0 MiB
最后更新 2025年12月10日
创建于 2025年12月10日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。