数据集概述
本数据集包含北极环斑海豹(Pusa hispida)的基因与遥测数据,用于研究其种群结构、基因流动、迁徙模式及长距离扩散潜力。数据覆盖三个亚种,整合了卫星遥测追踪的季节性移动信息与354只海豹的线粒体DNA(COI、控制区)和微卫星基因型分析结果,揭示了北极亚种内部及与波罗的海亚种间的高基因流动特征。
文件详解
- 线粒体DNA控制区数据文件
- 文件名称:Pusa_hispida_mtDNA_Control_Region_bp90_565_99individuals.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含99只环斑海豹的线粒体DNA控制区序列,长度为565碱基对,序列ID关联样本的国家和采样地点信息
- 线粒体DNA COI基因数据文件
- 文件名称:Pusa_hispida_mtDNA_COI_bp92_450_113individuals.fasta
- 文件格式:FASTA
- 字段映射介绍:包含113只环斑海豹的线粒体DNA COI基因序列,长度为450碱基对,序列ID关联样本的国家和采样地点信息
- 微卫星基因型数据文件
- 文件名称:Pusa_hispida_microsatellite_genotypes.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含环斑海豹的微卫星基因型数据,具体字段未详细说明,推测涵盖样本ID、基因型位点信息等
- 线粒体DNA控制区说明文件
- 文件名称:README_for_Pusa_hispida_mtDNA_Control_Region_bp90_565_99individuals.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供线粒体DNA控制区数据的样本信息,包含Sequence_ID(序列ID)、Country(国家)及具体采样地点(如加拿大Tuktoyaktuk、美国Peard Bay等)
- 线粒体DNA COI基因说明文件
- 文件名称:README_for_Pusa_hispida_mtDNA_COI_bp92_450_113individuals.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供线粒体DNA COI基因数据的样本信息,包含Sequence_ID(序列ID)、Country(国家)及具体采样地点(如加拿大Tuktoyaktuk、美国Peard Bay等)
数据来源
论文“Combined genetic and telemetry data reveal high rates of gene flow, migration, and long-distance dispersal potential in Arctic ringed seals (Pusa hispida)”
适用场景
- 种群遗传学研究: 分析北极环斑海豹的基因流动模式、种群结构及亚种间的遗传关联性
- 迁徙生态学分析: 结合基因数据与遥测信息,探究环斑海豹的长距离扩散潜力与季节性迁徙规律
- 气候变化影响评估: 研究海冰变化对环斑海豹生存繁殖及种群动态的潜在影响
- 生物多样性保护: 为北极环斑海豹的保护策略制定提供基因流动与种群连通性的科学依据
- 分子进化研究: 利用线粒体DNA序列分析环斑海豹的进化历史与遗传多样性