数据集概述
本数据集包含葡萄与黑麦根系丛枝菌根真菌群落的Illumina MiSeq原始序列数据,基于核糖体DNA基因的部分LSU区域测序,共三十个文件,均为FASTQ格式,存储于单个目录下。
文件详解
该数据集由一个目录下的多个FASTQ文件组成,具体说明如下:
- 目录: Illumina samples 1-15/(包含全部三十个文件)
- 文件类型: 所有文件均为FASTQ格式(.fastq),占比百分之百
- 文件示例(部分):
- Grapevine_Inoculated rye cover_3_fw_R1.fastq: 葡萄接种黑麦覆盖处理样本的正向R1原始序列
- Grapevine_herbicide_2_fw_R2.fastq: 葡萄除草剂处理样本的正向R2原始序列
- Rye_rye cover_1_fw_R2.fastq: 黑麦黑麦覆盖处理样本的正向R2原始序列
- Grapevine_rye cover_3_fw_R2.fastq: 葡萄黑麦覆盖处理样本的正向R2原始序列
- Rye_inoculated rye cover_1_fw_R2.fastq: 黑麦接种黑麦覆盖处理样本的正向R2原始序列
适用场景
- 微生物生态学研究: 分析葡萄与黑麦根系丛枝菌根真菌群落的物种组成与多样性
- 农业微生物研究: 探究不同处理(如黑麦覆盖、接种、除草剂)对菌根真菌群落的影响
- 分子生态学分析: 基于核糖体DNA LSU区域序列,进行真菌物种鉴定与系统发育分析
- 土壤微生物互作研究: 解析作物根系与丛枝菌根真菌的共生关系及环境响应机制