数据集概述
本数据集通过模拟实验研究17种DNA序列单倍型数据的汇总统计量,用于检测谱系融合的信号。研究覆盖不同DNA序列数据排列、是否存在瓶颈效应等场景,在融合后10个时间点采样计算统计量,分析其信号强度变化。
文件详解
- 文件名称:
README_for_Garrick_etal_2020_Simulated_Data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:模拟数据的说明文档,包含数据生成方法、场景设置等背景信息
- 文件名称:
README_for_Garrick_etal_2020_Supplementary_Tables.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:补充表格的说明文档,解释表格内容及统计量定义
- 文件名称:
Garrick_etal_2020_Simulated_Data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包,包含模拟生成的DNA序列单倍型数据文件(.alleles格式)
- 文件名称:
Garrick_etal_2020_Supplementary_Tables.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:补充表格,记录不同场景下各汇总统计量的计算结果及分析数据
数据来源
论文“Efficient summary statistics for detecting lineage fusion from phylogeographic datasets”
适用场景
- 谱系融合检测方法研究: 利用模拟数据验证和优化DNA序列数据中谱系融合信号的检测算法
- 生物多样性分析: 通过统计量分析评估谱系融合对物种多样性的影响
- 进化生物学研究: 模拟不同进化场景下谱系融合的信号变化,揭示物种进化过程
- 基因组数据处理: 比较不同DNA序列数据排列(读长vs位点数量)对谱系融合检测的影响
- 群体遗传学分析: 研究瓶颈效应对谱系融合信号检测的干扰及应对方法