数据集概述
本数据集是对PXD024291的重分析结果,来源于论文“De novo peptide databases enable protein-based stable isotope probing of microbial communities with up to species-level resolution”。数据包含蛋白质稳定同位素探测(Protein-SIP)相关的分析文件,涉及微生物群落代谢活性研究,总计43个文件,覆盖.tsv、.mztab、.xlsx三种格式。
文件详解
- .tsv文件(20个,占46.51%)
- 文件名称:遵循“2017-02-07_RS_Robo_数字.tsv”命名模式(如2017-02-07_RS_Robo_17.tsv)
- 字段映射:包含TITLE、DENOVO、Score、PPM Difference、Positional Score等分析字段
- .mztab文件(20个,占46.51%)
- 文件名称:遵循“2017-02-07_RS_Robo_数字.mztab”命名模式(如2017-02-07_RS_Robo_2.mztab)
- 来源:来自Casanovo的分析结果
- .xlsx文件(3个,占6.98%)
- 文件名称:包括PXD024291_18O_Blast_Others.xlsx、PXD024291_2H_Blast_Others.xlsx、PXD024291_Unipept_MetaProSIP_merged.xlsx
- 内容:合并Unipept与MetaProSIP输出及未匹配肽段的BLASTp结果
数据来源
论文“De novo peptide databases enable protein-based stable isotope probing of microbial communities with up to species-level resolution”
适用场景
- 微生物群落代谢活性研究:利用蛋白质稳定同位素探测数据分析物种水平的代谢活性
- 肽数据库构建应用:验证De novo肽数据库在微生物蛋白质组学分析中的分辨率
- 蛋白质组学重分析:对PXD024291原始数据的二次分析与结果验证
- 微生物生态功能解析:结合同位素探测技术研究复杂群落的功能多样性