数据集概述
本数据集通过TurboID邻近标记结合质谱技术，鉴定桃蚜（Myzus persicae）组织蛋白酶B（CathB6）在拟南芥（Arabidopsis thaliana）中的潜在互作蛋白。实验对比CathB6-TurboID与GFP-TurboID对照组样本，筛选出267个显著富集的拟南芥蛋白，为解析桃蚜通过CathB6调控植物以实现定殖的分子机制提供数据支持。
文件详解
- 核心数据文件：
- 数据存储库：ProteomeXchange Consortium via PRIDE partner repository
- 数据集标识符：PXD057789、10.6019/PXD057789
- 数据内容：包含CathB6-TurboID与GFP-TurboID样本的质谱原始数据、蛋白定量结果、差异富集分析数据
- 辅助分析文件：
- 表格1（Table 1）：列出显著富集的互作蛋白信息，包括蛋白名称、富集倍数、p值、重复样本一致性等
- 质谱分析结果：包含PCA分析、MA plot、Venn图等统计分析图表对应的原始数据
数据来源
ProteomeXchange Consortium via the PRIDE partner repository（数据集标识符PXD057789、10.6019/PXD057789）
适用场景
- 植物-昆虫互作机制研究：分析桃蚜CathB6与拟南芥蛋白的互作网络，揭示蚜虫定殖的分子调控途径
- 农业害虫防控靶点筛选：基于互作蛋白鉴定，挖掘干扰蚜虫-植物互作的潜在分子靶点
- 蛋白组学技术应用验证：评估TurboID邻近标记技术在植物-昆虫互作研究中的有效性
- 植物免疫反应机制分析：研究拟南芥响应蚜虫CathB6的蛋白表达变化及信号通路激活情况
