Q_trajectories_Based_快速折叠蛋白记忆核提取与平均首通时间分析数据

数据集概述

本数据集包含Dalton等人PNAS 2023研究中8种快速折叠蛋白的天然接触分数反应坐标（Q）轨迹及对应自由能谱，同时提供用于自由能计算、平均首通时间、相关函数计算和记忆核提取的C++示例分析代码，是研究蛋白质折叠动力学的关键数据资源。

文件详解

• 压缩文件
• 文件名称：Dalton_etal_PNAS_2023.zip
• 文件格式：ZIP
• 字段映射介绍：压缩包内含8种快速折叠蛋白的Q(t)轨迹数据、对应自由能谱数据，以及用于自由能计算、平均首通时间计算、速度-速度相关函数与位置-力相关函数计算、记忆核提取的C++示例分析代码。

数据来源

Shaw Research（原始全原子数据需联系该机构获取）

适用场景

• 蛋白质折叠动力学研究: 分析快速折叠蛋白的Q轨迹，探究折叠过程中的动力学特征。
• 自由能谱分析: 利用自由能谱数据研究蛋白质折叠的能量景观和稳定态分布。
• 记忆核提取方法验证: 通过示例代码验证和优化记忆核提取算法在蛋白质动力学研究中的应用。
• 平均首通时间计算: 计算蛋白质折叠过程中的平均首通时间，评估折叠速率与机制。
• 分子动力学模拟辅助分析: 为快速折叠蛋白的全原子模拟提供参考数据和分析工具支持。