数据集概述
本数据集包含对千基因组非非洲人群及SGDP巴布亚人群数据进行Sprime分析的结果，含压缩格式的分析输出文件、用于复现相关研究论文图4的R代码及说明文档，为人类古基因组混合研究提供数据支持。
文件详解
- 文档文件:
- README: 无扩展名文件，提供数据集内容概述、分析背景及文件说明。
- 代码文件:
- contour_plot.R: R脚本文件，用于复现论文《Analysis of human sequence data reveals two pulses of archaic admixture from Denisovans》中的图4。
- 分析结果文件:
- 多个.tar.gz压缩包文件，包含不同人群的Sprime分析结果，如PUR_sprime_results.tar.gz、PJL_sprime_results.tar.gz、IBS_sprime_results.tar.gz、CHS_sprime_results.tar.gz等，共二十个压缩包。每个结果文件包含染色体、位置（基于build 37）、变异ID、参考等位基因、替代等位基因等至少八列数据。
适用场景
- 古基因组学研究: 分析千基因组非非洲人群与巴布亚人群的古人类混合信号。
- 群体遗传学分析: 探究不同人群的遗传变异特征及演化关系。
- 论文结果复现: 复现相关研究中关于丹尼索瓦人混合事件的图4结果。
- 生物信息学方法验证: 验证Sprime分析工具在人类群体数据中的应用效果。
