数据集概述
本数据集包含用于评估转录组数据在推断鞘翅目头足类系统发育关系中效用的相关文件，包括分析所用数据矩阵、生成的系统发育树文件、数据处理脚本及头足类核心直系同源基因集，支持复现研究结果。
文件详解
- 说明文档文件（.txt格式）：
- cephalopod_core_ortholog_set_readme.txt：头足类核心直系同源基因集说明文档
- tree_files_readme.txt：系统发育树文件说明文档
- scripts_readme.txt：数据处理脚本说明文档
- data_files_readme.txt：数据集文件说明文档
- 压缩包文件（.zip格式）：
- cephalopod-core-ortholog-set.zip：头足类核心直系同源基因集压缩包
- tree-files.zip：系统发育树文件压缩包
- scripts.zip：数据处理脚本压缩包（含ceph_hamstr_outtofastas.sh等脚本）
- data-files.zip：分析所用数据矩阵压缩包
适用场景
- 头足类系统发育研究：用于分析转录组数据对鞘翅目头足类亲缘关系推断的有效性
- 生物信息学方法验证：评估HaMStR等工具在头足类直系同源基因分析中的应用效果
- 转录组数据应用研究：探究转录组数据在系统发育关系重建中的优势与局限性
- 科研结果复现：支持复现Lindgren和Anderson关于头足类系统发育的研究结论
