数据集概述
本数据集围绕热带森林恢复展开,对比多种子批次种植与自然更新的遗传多样性差异。以热带栎树Quercus bambusifolia为研究对象,分析多种子批次种植、单种子批次种植及自然种群的遗传多样性和遗传结构,验证不同恢复策略的遗传恢复效率,为森林恢复的繁殖体采集标准提供数据支持。
文件详解
- 文件名称:SSR_for_Quercus_bambusifolia_natural_and_planting-fem.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含热带栎树Quercus bambusifolia自然种群、多种子批次种植种群及单种子批次种植种群的SSR(简单序列重复)遗传标记数据,可用于计算遗传多样性指数(如He)、有效种群大小(如Ne_p)等核心指标。
- 文件名称:Rscript_for_allele_number.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:R语言分析脚本,包含加载adegenet、ggplot2等库的代码,以及读取结构数据文件、计算等位基因数量的程序逻辑,支持对遗传数据的自动化分析。
数据来源
论文“Using multiple seedlots in restoration planting enhances genetic diversity compared to natural regeneration in fragmented tropical forests”
适用场景
- 森林生态恢复策略评估:对比不同种子批次种植方式与自然更新的遗传多样性差异,优化热带森林恢复方案。
- 植物种群遗传学研究:分析Quercus bambusifolia不同种群的遗传结构、遗传多样性指数及有效种群大小。
- 生态保护决策支持:为碎片化热带森林恢复中繁殖体采集的批次数量、时间跨度等标准提供数据依据。
- 遗传数据分析方法应用:基于SSR标记数据及R脚本,开展植物种群等位基因数量计算、遗传多样性评估等实践研究。