R_group_Based_药物化学常用R基团替换资源数据库

数据集概述

本数据集为药物化学领域常用R基团及其优选替换方案的数据库,包含R基团替换层级结构与网络关系数据,配套说明文档详细解释数据组织规则,将随作者即将发表的论文发布,共含3个文件。

文件详解

  • 文件名称:readme.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:数据库说明文档,阐述R基团替换层级结构规则,说明XML文件中"center"元素(含degree、SMILES属性)及first layer、second layer子元素(含SMILES、edge_weight)的组织逻辑。
  • 文件名称:edges_final_network.csv
  • 文件格式:CSV
  • 字段映射介绍:含source(源R基团SMILES)、target(目标替换基团SMILES)、edge_weight(边权重)三个字段,记录R基团替换网络的关系数据。
  • 文件名称:top500_R_replacements.xml
  • 文件格式:XML
  • 字段映射介绍:含500个"center"子元素(代表核心R基团,含degree、SMILES属性),每个center下有first layer、second layer子元素(代表替换层级,含SMILES、edge_weight子元素)。

适用场景

  • 药物化学分子设计: 用于查询常用R基团的优选替换方案,辅助药物分子结构优化。
  • 药物研发基团替换分析: 基于XML层级结构与CSV网络数据,研究R基团替换的优先级与关联性。
  • 药物化学数据库构建: 作为基础数据补充到药物研发相关的基团资源库中。
  • 药物分子结构改造研究: 利用edge_weight分析替换方案的权重关系,指导分子结构改造策略。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 102.27 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。