数据集概述
本数据集围绕陆地蜗牛Cepaea nemoralis的壳色与条带多态性展开,通过6组实验室杂交实验(含323个个体)验证壳色(C)和条带(B)位点无重组,并利用RAD-Seq技术从2对亲本和22个子代中筛选出44个与C、B位点连锁的标记,构建覆盖超基因两侧、总长35.8cM的连锁图谱,为Cepaea分子生态学研究提供遗传标记支持。
文件详解
- 文件名称:Cepaea crosses colour and banding phenotype data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含6组Cepaea nemoralis实验室杂交个体的壳色与条带表型数据,记录323个个体的表型分型结果,用于验证C和B位点的遗传连锁关系。
- 文件名称:Cepaea linkage map genotypes dataset.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含RAD-Seq标记的基因型数据,涉及22个核心子代及146个扩展子代的标记分型结果,用于构建覆盖超基因两侧的35.8cM连锁图谱。
- 文件名称:Cepaea nemoralis RAD markers RAD-tag and paired-end sequence assemblies.fas
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含与壳色(C)和条带(B)位点连锁的RAD-Seq标记序列,共44个匿名标记的RAD-tag及双端测序组装序列。
适用场景
- 分子生态学研究: 用于重建Cepaea nemoralis作为分子生态模型,分析壳色与条带超基因的遗传结构。
- 遗传连锁图谱构建: 基于RAD-Seq标记数据,研究超基因位点的连锁关系及图谱扩展。
- 自然选择机制分析: 结合表型与基因型数据,探究壳色多态性维持的自然选择机制。
- 超基因进化研究: 利用侧翼标记分析Cepaea nemoralis超基因的进化起源与结构特征。