数据集概述
本数据集为小黄鱼（Larimichthys polyactis）的全基因组单核苷酸多态性（SNP）资源，通过RAD-seq技术对两个种群的24个个体测序生成，包含27556个SNP位点。数据涉及遗传变异分析、种群分化检测及局部适应性评估，可支持小黄鱼种群遗传学与基因组学研究。
文件详解
- Admixture_Lositan_input_files.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含用于LOSITAN软件进行FST异常值检测的输入文件，支持局部适应性分析。
- XHY_small_yellow_croaker_sequence_assembly.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含小黄鱼RAD-seq测序数据的序列组装结果文件。
- XHY_small_yellow_croaker_SNP_statistics.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含SNP位点的统计分析结果，如核苷酸多样性（π）、有效种群大小估计值等遗传参数。
- XHY_small_yellow_croaker_SNP.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含小黄鱼全基因组SNP位点数据集，包括高质量SNP、中性位点、高FST位点及异常值SNP等子集。
适用场景
- 鱼类种群遗传学研究: 分析小黄鱼种群的遗传结构、有效种群大小及遗传多样性。
- 适应性进化研究: 利用异常值SNP数据探究小黄鱼局部适应性相关的候选基因及生物学功能。
- 基因组资源开发: 为小黄鱼后续基因组学研究提供SNP标记资源。
- 种群分化评估: 比较不同SNP子集（高质量、中性、高FST、异常值）对种群分化检测结果的影响。
