数据集概述
本数据集围绕欧洲林蛙（Rana temporaria）的冰期后再殖民历史展开，包含瑞士种群的细胞色素b（cytb）和COXI基因序列数据，以及单倍型、系统发育分析相关文件，揭示其从意大利北部避难所经跨阿尔卑斯和环阿尔卑斯路线殖民瑞士的过程，共8个文件。
文件详解
- 数据说明文件
- 文件名称：README_Jansen_van_Rensburg_R.temporaria_Phylogeography_2021.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含研究背景、数据采集说明、文件清单及使用指引等元数据信息
- 细胞色素b（cytb）序列文件
- 文件名称：R.temp_cytb_969indivs.331bp.meg、R.temp_cytb_368indivs.448bp.meg
- 文件格式：.meg
- 字段映射介绍：分别记录969个个体331bp、368个个体448bp的cytb基因序列数据
- COXI基因序列文件
- 文件名称：R.temp_COXI_183indivs.628bp.meg、R.temp_COXI_283indivs.569bp.meg
- 文件格式：.meg
- 字段映射介绍：分别记录183个个体628bp、283个个体569bp的COXI基因序列数据
- 单倍型系统发育分析文件
- 文件名称：cytb_63Haplotypes_331bp.mb.nex、COX1_27Haplotypes_628bp.mb.nex、Concat_57Haplotypes_956bp.mb.nex
- 文件格式：.nex
- 字段映射介绍：分别包含cytb基因63个单倍型（331bp）、COXI基因27个单倍型（628bp）、联合基因57个单倍型（956bp）的系统发育分析输入数据
数据来源
论文“European common frog (Rana temporaria) recolonised Switzerland from multiple glacial refugia in northern Italy via trans- and circum-Alpine routes”
适用场景
- 冰期后生物再殖民研究：分析欧洲林蛙从意大利北部避难所殖民瑞士的路线及种群分化过程
- 种群遗传学分析：利用基因序列数据研究欧洲林蛙的遗传多样性、单倍型分布及种群结构
- 生物地理学研究：探讨阿尔卑斯山脉对物种扩散的屏障作用及跨山脉殖民机制
- 系统发育分析：基于单倍型数据构建欧洲林蛙的系统发育树，揭示其进化关系
- 气候变化与物种分布研究：结合地质历史事件，分析气候变化对物种避难所选择及扩散路线的影响
