数据集概述
本数据集围绕禁牧处理下灌木荒漠草原的稀有类群与土壤有机碳积累关系展开,包含样本元数据、多样性指数、OTU表、细菌组成数据及相关分析代码,共11个文件,用于支撑生态学研究中稀有类群对土壤碳积累的驱动机制分析。
文件详解
- 数据文件(共6个)
metadata.csv(CSV格式):包含样本ID、土层(如0-5 cm)、处理方式(GE,即禁牧)、样点、样点处理组合等字段
diversity index.csv(CSV格式):包含不同土层(0-5 cm、5-10 cm)、不同处理下的样本Shannon指数、Simpson指数等多样性指标
Different OTU table.xlsx(XLSX格式):不同类群的OTU(操作分类单元)表数据
Different bacterial compositions.xlsx(XLSX格式):不同细菌组成的相关数据
OTU table.xlsx(XLSX格式):整体OTU表数据
SEM.xlsx(XLSX格式):结构方程模型(SEM)相关数据
- 代码文件(共5个)
zipi.R、SEM.R、Screening of different bacterial species.R、RF.R、SHAIXUAN.R(均为R格式):分别用于零膨胀泊松模型、结构方程模型、不同细菌物种筛选、随机森林分析及数据筛选的分析代码
适用场景
- 草原生态学研究:分析禁牧处理对灌木荒漠草原土壤有机碳积累的影响机制
- 微生物生态学研究:探究稀有类群(Rare taxa)在土壤碳循环中的作用
- 生物多样性与生态功能关系研究:通过多样性指数分析微生物多样性与土壤有机碳积累的关联
- 生态模型构建:利用SEM数据及代码构建土壤碳积累驱动因素的结构方程模型
- 微生物群落分析:基于OTU表和细菌组成数据解析草原土壤微生物群落结构特征