数据集概述
本数据集围绕RAR特异性激动剂对神经元-星形胶质细胞命运的转录调控展开,包含小鼠干细胞分化及脑类器官培养的基因表达数据,涉及单细胞转录组与空间转录组分析,揭示不同RAR激动剂对神经组织形成的影响。
文件详解
该数据集由多个文件和目录组成,具体说明如下:
- 空间矩阵文件(位于Normalized_spatialMatrices_BrainOrganoids/目录下):
- readme_SpatialOmics_processing.txt:TXT格式,可能包含空间组学数据处理说明
- VitaminA_mouseBORGs_3Months_QNorm_SrTmatrix.tsv:TSV格式,维生素A处理的小鼠脑类器官标准化空间矩阵
- ATRA_mouseBORGs_3Months_QNorm_SrTmatrix-aY8nS0.tsv:TSV格式,ATRA处理的小鼠脑类器官标准化空间矩阵
- BMS753_mouseBORGs_3Months_QNorm_SrTmatrix.tsv:TSV格式,BMS753处理的小鼠脑类器官标准化空间矩阵
- BMS961+BMS641_mouseBORGs_3Months_QNorm_SrTmatrix-Mw4fPF.tsv:TSV格式,BMS961+BMS641处理的小鼠脑类器官标准化空间矩阵
- 图像文件(位于Images_BrainOrganoids/目录下):
- VitaminA_mouseBORGs_3Months.png:PNG格式,维生素A处理的三个月小鼠脑类器官图像
- ATRA_mouseBORGs_3Months.png:PNG格式,ATRA处理的三个月小鼠脑类器官图像
- BMS753_mouseBORGs_3Months.png:PNG格式,BMS753处理的三个月小鼠脑类器官图像
- BMS961+BMS641_mouseBORGs_3Months.png:PNG格式,BMS961+BMS641处理的三个月小鼠脑类器官图像
适用场景
- 神经发育研究:分析不同RAR激动剂对神经元亚型分化的调控机制
- 转录组学分析:探究神经元-星形胶质细胞命运决定的转录组特征
- 空间生物学研究:利用空间转录组数据解析脑类器官的空间基因表达模式
- 药物研发:评估RAR特异性激动剂在神经组织工程中的应用潜力
- 类器官模型研究:分析脑类器官中神经组织形成的空间特异性调控