数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB1052品系(trpa-1(ok999)IV基因突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含食物OP50的培养条件下,经30分钟适应后的行为表现,包含视频追踪数据及特征提取结果,为研究trpa-1基因功能提供行为学依据。
文件详解
- 主数据文件:trpa-1 (ok999)IV on food R_2015_07_07__16_30_0134.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含21478个分割骨架信息,关联实验时长、帧率、像素微米比等基础参数
- 特征数据文件:trpa-1 (ok999)IV on food R_2015_07_07__16_30_0134_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、骨架形态等量化特征
- 行为数据压缩文件:trpa-1 (ok999)IV on food R_2015_07_07__16_30_0134.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,遵循wcon格式标准,包含结构化的行为时间序列信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析trpa-1基因突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响,探究该基因在行为调控中的作用
- 线虫行为学分析:基于视频追踪数据研究线虫的运动轨迹、速度、身体弯曲等行为特征的量化规律
- 分子生物学实验验证:为trpa-1基因相关的分子机制研究提供在体行为学实验数据支持
- 行为数据分析方法优化:利用标准化的行为特征数据,测试或改进线虫行为特征提取算法的准确性