数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫RB1052 trpa-1(ok999)IV品系的行为实验数据,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的运动行为,包含视频追踪数据、特征提取结果及原始实验参数,可用于分析trpa-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为数据压缩包
- 文件名称:trpa-1 (ok999)IV on food r_2015_07_14__15_55_0853.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,采用wcon格式存储
- 特征提取文件
- 文件名称:trpa-1 (ok999)IV on food r_2015_07_14__15_55_0853_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,由tierpsy软件提取生成
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:trpa-1 (ok999)IV on food r_2015_07_14__15_55_0853.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含24089个分段骨架数据,记录线虫运动轨迹的原始追踪结果
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析trpa-1基因缺失对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 模式生物行为学分析:基于线虫骨架数据和运动特征,研究其在特定环境下的行为模式
- 神经生物学实验验证:验证E. Yemini等人建立的线虫行为分析方法的重复性
- 遗传突变体筛选:作为基因编辑线虫品系行为表型的参考数据集