数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫RB1374品系(携带ocr-3基因ok1559突变)的行为实验记录,属于C.elegans行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为数据,包含视频追踪数据、特征提取结果等,可用于研究该基因突变对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为追踪数据文件:
- 文件名称:ocr-3 (a1537) on food L_2010_04_23__12_19_3768.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含视频帧对应的线虫骨架分割信息等基础行为数据
- 特征提取结果文件:
- 文件名称:ocr-3 (a1537) on food L_2010_04_23__12_19_3768_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含通过tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,如运动轨迹、身体姿态参数等
- 行为数据压缩文件:
- 文件名称:ocr-3 (a1537) on food L_2010_04_23__12_19_3768.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,可能包含标准化格式的行为记录信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析ocr-3基因ok1559突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 线虫行为学分析:基于视频追踪数据研究线虫的运动轨迹、速度、身体弯曲等行为特征
- 实验方法验证:验证Tierpsy软件在秀丽隐杆线虫行为特征提取中的应用效果
- 模式生物行为机制研究:探索特定培养条件(如NGM低蛋白胨培养基、OP50食物)下的线虫行为响应机制