数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB1809品系(ins-30(ok2343)I基因突变体)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为特征,包含实验参数、视频追踪数据及特征提取结果,可用于研究ins-30基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:
ins-30 (ok2343)I on food L_2011_05_12__11_00___3___2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含26696个分段骨架信息,记录线虫运动的空间坐标及时序特征
- 特征提取文件(.hdf5格式)
- 文件名称:
ins-30 (ok2343)I on food L_2011_05_12__11_00___3___2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:基于原始追踪数据提取的行为特征,包含线虫运动速度、弯曲度、轨迹复杂度等量化指标
- 行为数据压缩文件(.zip格式)
- 文件名称:
ins-30 (ok2343)I on food L_2011_05_12__11_00___3___2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式记录标准化的行为时序信息
数据来源
C.elegans behavioural database(线虫行为数据库)
适用场景
- 基因功能研究:分析ins-30基因突变对线虫运动行为、觅食策略等表型的影响
- 线虫行为学分析:基于视频追踪数据研究线虫在食物环境中的行为模式及节律特征
- 行为特征量化:利用特征提取文件中的指标,建立线虫行为表型的量化分析模型
- 实验方法验证:参考实验 protocol 及追踪软件参数,复现线虫行为学实验的标准化流程