数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB2067品系flp-9(ok2730)IV基因突变体的行为实验数据。实验于2010年1月13日开展,包含成年雌雄同体线虫在特定培养条件下的行为记录,通过Tierpsy软件追踪分析,生成行为特征数据,可用于研究flp-9基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 文件名称:flp-9 (ok2730)V on food R_2010_01_13__12_1436.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为追踪的原始数据,可能涵盖视频帧对应的线虫位置、骨架结构等基础行为数据
- 文件名称:flp-9 (ok2730)V on food R_2010_01_13__12_1436_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含提取的线虫行为特征数据,基于Tierpsy软件分析生成,可能涵盖运动速度、身体弯曲度、轨迹等特征指标
- 文件名称:flp-9 (ok2730)V on food R_2010_01_13__12_1436.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(WCON格式压缩包)
- 字段映射介绍:包含线虫行为数据的标准化格式文件,WCON格式用于存储线虫行为追踪的时间序列数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析flp-9基因缺失对秀丽隐杆线虫行为表型的影响,探究神经肽基因的功能
- 行为生物学分析:基于追踪数据研究线虫的运动模式、觅食行为等基础行为特征
- 实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为实验的标准化流程
- 生物信息学工具应用:用于测试或优化Tierpsy等线虫行为追踪软件的分析性能