数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB2119品系(携带acr-23(ok2804)V突变)的行为实验记录,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基、OP50食物条件下的行为特征,包含视频及处理后的行为特征数据,可用于研究acr-23基因对其行为的影响。
文件详解
- 行为特征文件:
- 文件名称:acr-23 (ok2804)V on food R_2010_02_23__10_14_2114_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动、形态等特征参数
- 核心数据文件:
- 文件名称:acr-23 (ok2804)V on food R_2010_02_23__10_14_2114.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验核心数据,包含19279个分段骨架数据,对应视频中提取的线虫形态信息
- 压缩行为数据文件:
- 文件名称:acr-23 (ok2804)V on food R_2010_02_23__10_14_2114.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式记录行为轨迹等信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究: 分析acr-23基因缺失突变对秀丽隐杆线虫行为模式的影响
- 神经生物学实验: 探究乙酰胆碱受体相关基因与线虫运动、觅食等行为的关联机制
- 模式生物行为分析: 基于标准化实验条件下的行为数据,建立线虫行为表型研究模型
- 生物信息学算法验证: 作为tierpsy等行为分析软件的测试数据集,验证特征提取算法的准确性