数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)RB2294 acr-6(ok3117)I品系的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的行为表现,包含视频追踪数据、特征提取结果等,用于线虫行为学研究。
文件详解
- 核心数据文件:
- 文件名称:acr-6 (ok3117) on food R_2010_02_19__15_22_08215.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为视频的原始追踪数据,包含19515个分段骨骼数据,关联视频参数(帧率25.641fps、像素对应4.1716微米)、总时长898.56秒等基础信息
- 特征数据文件:
- 文件名称:acr-6 (ok3117) on food R_2010_02_19__15_22_08215_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含行为轨迹、运动参数等分析指标
- 标准化格式文件:
- 文件名称:acr-6 (ok3117) on food R_2010_02_19__15_22_08215.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:以标准化wcon格式存储的线虫行为数据压缩包,便于跨平台共享与解析
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究:分析acr-6基因缺陷对线虫运动行为的影响,探究基因功能与行为表型的关联
- 神经生物学实验验证:验证acr-6基因在调控线虫摄食、运动等行为中的作用机制
- 模式生物行为数据分析:作为标准化线虫行为实验数据,支持行为学算法开发与验证
- 跨实验室数据对比:基于统一 protocol(E. Yemini et al. 方法)的实验数据,可用于不同实验室线虫行为研究结果的交叉验证