数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB557品系(携带asic-2(ok289)等位基因)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2015年10月15日在英国MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪线虫行为,包含特征数据、原始追踪数据及wcon格式压缩文件,总计3个文件。
文件详解
- 行为特征数据文件
- 文件名称:RB557 on food L_2015_10_15__14_00_5857_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为特征数据,包含由tierpsy软件提取的运动、姿态等行为特征参数
- 原始追踪数据文件
- 文件名称:RB557 on food L_2015_10_15__14_00_5857.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的原始追踪数据,包含时间序列的位置、骨架等基础数据
- 压缩行为数据文件
- 文件名称:RB557 on food L_2015_10_15__14_00_5857.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(包含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式记录标准化的行为数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析asic-2基因对秀丽隐杆线虫行为表型的影响
- 行为生物学分析:研究成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白琼脂培养基上的运动、觅食等行为模式
- 基因功能验证:验证asic-2基因在调控线虫行为中的作用机制
- 行为追踪技术应用:评估tierpsy软件在线虫行为特征提取中的准确性和有效性
- 神经科学研究:探究神经系统相关基因与行为表型之间的关联