数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)行为数据库的一部分,记录了RB680品系(携带asic-1基因ok415等位突变)成虫在含OP50食物的NGM培养基中的行为实验数据。实验于2010年7月6日开展,包含视频追踪原始数据及行为特征分析结果,可用于研究ASIC-1基因对秀丽隐杆线虫行为的影响。
文件详解
- 行为坐标数据文件:asic-1 (ok415) on food L_2010_07_06__11_05_4644.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含线虫行为轨迹的坐标数据,基于wcon格式存储,记录线虫在实验过程中的位置变化信息
- 行为特征数据文件:asic-1 (ok415) on food L_2010_07_06__11_05_4644_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包括运动轨迹、身体姿态等量化指标
- 原始追踪数据文件:asic-1 (ok415) on food L_2010_07_06__11_05_4644.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含实验视频的原始追踪结果,记录了899.248秒内(25.5102帧/秒)的线虫骨架分割数据(共17237个分割骨架)及像素与微米的映射关系(4.59377微米/像素)
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析asic-1基因ok415突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 线虫行为学分析:基于视频追踪数据研究线虫在食物环境中的觅食、移动等行为模式
- 神经生物学实验:结合基因背景与行为特征,探究ASIC-1通道蛋白在神经调控中的作用
- 行为数据分析方法验证:利用标准化实验数据测试线虫行为特征提取算法的有效性