数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)RB756 gar-2(ok520)III品系的行为实验数据,包含成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM琼脂培养基中的运动行为记录,实验由MRC分子生物学实验室完成,数据存储于C.elegans行为数据库,可用于分析gar-2基因对线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:gar-2 (ok250)III on food R_2010_07_22__11_27_03__2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为实验的原始记录数据,包含视频帧对应的线虫形态、位置等基础信息
- 特征数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:gar-2 (ok250)III on food R_2010_07_22__11_27_03__2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为特征提取结果,对应26857个分割骨架数据,可反映线虫运动轨迹、身体弯曲度等行为指标
- 压缩行为数据文件(.zip格式)
- 文件名称:gar-2 (ok250)III on food R_2010_07_22__11_27_03__2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据,采用wcon格式记录线虫运动的时间序列信息
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析gar-2基因缺失突变体(ok520)对线虫运动行为的影响
- 神经行为学机制探索:通过行为特征数据研究线虫神经回路与行为表型的关联
- 模式生物行为分析:作为标准化线虫行为实验数据,支持模式生物行为学方法验证
- 生物信息学算法测试:用于验证线虫行为特征提取算法(如tierpsy软件)的准确性