Red_Wolf_Based_贝叶斯聚类方法检测基因混合能力评估数据

数据集概述

本数据集基于美国北卡罗来纳州重新引入的红狼种群基因数据,评估BAPS和STRUCTURE两种贝叶斯聚类程序检测基因混合与渐渗的能力。包含977个个体的17个微卫星位点基因型数据,以及对应分析输入文件与说明文档,可用于验证基因混合检测方法的准确性。

文件详解

  • README_for_STRUCTURE_input_files.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含STRUCTURE分析的参数设置与文件说明,涉及个体数量(977)、位点数量(17)、倍性(2)、缺失数据标识(-9)、燃烧期长度(100000)、MCMC重复次数(1000000)等信息
  • BAPS_input_files.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:BAPS程序的输入文件压缩包
  • Canid_genotypes_Dryad.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含个体(Individual)、分组(Group)、分配聚类(Assigned cluster)及17个微卫星位点(如CXX172A、CXX172B等)的基因型数据
  • STRUCTURE_input_files.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:STRUCTURE程序的输入文件压缩包

适用场景

  • 基因混合检测方法评估: 对比BAPS与STRUCTURE在红狼种群基因混合检测中的准确性与误判率
  • 濒危物种基因管理: 为红狼等濒危物种的基因混合监测与管理提供方法验证依据
  • 微卫星位点数据分析: 利用17个微卫星位点数据开展基因多样性与种群结构研究
  • 贝叶斯聚类方法优化: 分析训练集组成与位点数对聚类结果准确性的影响
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.8 MiB
最后更新 2026年1月27日
创建于 2026年1月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。