热带非洲新物种Ripartitella_degreefii系统发育推断数据集表2

数据集概述

该数据集为表格式数据,记录了用于热带非洲新物种Ripartitella degreefii(口蘑科)系统发育推断的数据集信息,包含ITS和LSU两个基因片段的比对长度、排除字符、碱基频率等核心参数,支持物种分类学研究。

文件详解

  • 文件名称: table.html
  • 文件格式: HTML (.html)
  • 字段映射:
  • Datasets: 基因片段(ITS、LSU)
  • Alignment size: 比对长度(ITS:840、LSU:1100)
  • Excluded characters: 排除字符数(ITS:16、LSU:无数据)
  • Model selected: 选择的进化模型(均为GTR+I+G)
  • Likelihood score: 似然值(ITS:5875.1128、LSU:3211.9116)
  • Base frequencies: 碱基频率(A、C、G、T)
  • Proportion of invariable sites: 不变位点比例
  • Gamma shape: 伽马形状参数
  • Test of substitution saturation: 替换饱和性检验指标(Iss、Iss.cSym、Iss.cAsym、P值)

适用场景

  • 真菌分类学研究: 支持Ripartitella degreefii新物种的系统发育分析与分类鉴定
  • 分子进化分析: 用于评估ITS和LSU基因片段的替换饱和性及进化模型适用性
  • 生物多样性研究: 为热带非洲真菌区系的物种多样性研究提供分子数据支撑
  • 系统发育方法验证: 可作为测试不同进化模型和饱和性检验方法的案例数据
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.0 MiB
最后更新 2025年12月15日
创建于 2025年12月15日
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