数据集概述
该数据集为表格式数据,记录了用于热带非洲新物种Ripartitella degreefii(口蘑科)系统发育推断的数据集信息,包含ITS和LSU两个基因片段的比对长度、排除字符、碱基频率等核心参数,支持物种分类学研究。
文件详解
- 文件名称: table.html
- 文件格式: HTML (.html)
- 字段映射:
- Datasets: 基因片段(ITS、LSU)
- Alignment size: 比对长度(ITS:840、LSU:1100)
- Excluded characters: 排除字符数(ITS:16、LSU:无数据)
- Model selected: 选择的进化模型(均为GTR+I+G)
- Likelihood score: 似然值(ITS:5875.1128、LSU:3211.9116)
- Base frequencies: 碱基频率(A、C、G、T)
- Proportion of invariable sites: 不变位点比例
- Gamma shape: 伽马形状参数
- Test of substitution saturation: 替换饱和性检验指标(Iss、Iss.cSym、Iss.cAsym、P值)
适用场景
- 真菌分类学研究: 支持Ripartitella degreefii新物种的系统发育分析与分类鉴定
- 分子进化分析: 用于评估ITS和LSU基因片段的替换饱和性及进化模型适用性
- 生物多样性研究: 为热带非洲真菌区系的物种多样性研究提供分子数据支撑
- 系统发育方法验证: 可作为测试不同进化模型和饱和性检验方法的案例数据