数据集概述
本数据集为热带河流生态系统鱼类生物多样性研究的配套数据与代码，包含环境DNA（eDNA）测序数据、遥感变量数据及分析脚本，用于支持论文“Combining environmental DNA and remote sensing variables to model fish biodiversity in tropical river ecosystems”的研究工作。
文件详解
该数据集为压缩包文件，内部包含数据文件夹和脚本文件夹，具体说明如下：
- 压缩包文件:
- tropical_river_edna_compressed.zip: ZIP格式压缩包，包含以下子文件及目录
- data/文件夹:
- swarm_output_clean/: SWARM聚类算法的清理后输出数据
- rs_variables/: 各采样点的遥感变量数据
- site_sample_mapping/: 样本与采样点的映射关系数据（通常每个采样点两个重复样本）
- scripts/文件夹:
- global_model.Rmd: 全球生物多样性建模脚本（R Markdown格式）
- local_model_maroni.Rmd: 马罗尼河局部建模脚本（R Markdown格式）
- local_model_oyapock.Rmd: 奥亚波克河局部建模脚本（R Markdown格式）
- plots.R: 绘图代码（R脚本格式）
- helper_functions.R: 可复用辅助函数（R脚本格式）
- calculating_per_sample_metrics.R: 样本生物多样性指标计算脚本（R脚本格式）
适用场景
- 生态学研究: 热带河流鱼类生物多样性建模与分析
- 环境DNA技术应用: 验证eDNA技术在生物多样性监测中的有效性
- 遥感技术应用: 探究遥感变量与水生生物多样性的关联
- 跨学科研究: 整合分子生态学与遥感技术的生态模型构建
- 河流生态保护: 为热带河流生态系统保护策略制定提供数据支持
