热带鲨鱼多样性环境DNA序列数据集2017

数据集概述

该数据集为2017年研究中使用的热带鲨鱼多样性环境DNA（eDNA）序列数据，包含经质量过滤、双端比对和长度筛选后的唯一序列，未经过聚类或分类学分配，记录了样本读取丰度、总读取数和序列长度等信息。

文件详解

• 文件名称: SHAK.new.fasta
• 文件格式: FASTA（.fasta）
• 内容说明: 包含经预处理的唯一eDNA序列，属性含merged_sample（样本读取丰度）、count（总读取数）、seq_length（序列长度），样本编码和元条形码流程详见发表论文。

数据来源

Bakker J, Wangensteen OS, Chapman DD, Boussarie G, Buddo D, Guttridge TL, Hertler H, Mouillot D, Vigliola L, Mariani S

适用场景

• 海洋生物学研究: 分析热带鲨鱼物种多样性及分布特征
• 环境DNA技术应用: 验证eDNA方法在鲨鱼监测中的有效性
• 生物多样性保护: 评估人类活动对鲨鱼群落的影响
• 分子生态学分析: 研究鲨鱼eDNA序列特征与丰度关联