Reliability_Based_无效等位基因检测方法可靠性评估数据

数据集概述

本数据集围绕微卫星无效等位基因检测方法的可靠性评估展开,包含田鼠自然种群8年基因型数据、1200个无无效等位基因的瓶颈模拟种群数据、120个含已知无效等位基因的模拟种群数据,用于分析不同检测方法间的一致性及检测误差特征。

文件详解

  • README_for_Genotypes_data.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:提供数据集整体说明,包括压缩包内文件结构(Simulated_genotypes文件夹、Simulated_genotypes_subpopulations文件夹、Microtus_oeconomus_genotypes.csv文件)及模拟数据的生成背景(SPAms软件模拟、瓶颈程度与持续时间变量)。
  • Genotypes_data.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包包含两类文件夹和一个CSV文件。Simulated_genotypes文件夹含1200个模拟种群基因型(分24个子文件夹,对应不同瓶颈水平与持续时间);Simulated_genotypes_subpopulations文件夹为模拟种群亚群数据;Microtus_oeconomus_genotypes.csv为田鼠自然种群基因型数据。

数据来源

论文“Reliability assessment of null allele detection: inconsistencies between and within different methods”

适用场景

  • 群体遗传学方法验证: 评估微卫星无效等位基因检测方法的一致性与可靠性,为方法选择提供依据。
  • 无效等位基因检测误差分析: 研究自然种群与模拟种群中检测方法的假阳性、假阴性率及瓶颈效应的影响。
  • 种群遗传数据分析校正: 指导自然种群微卫星数据中无效等位基因干扰的处理策略。
  • 模拟种群遗传学研究: 利用模拟数据探索瓶颈强度、持续时间对无效等位基因检测的干扰机制。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.91 MiB
最后更新 2026年1月26日
创建于 2026年1月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。