人类基因表达样本信息数据集HumanGeneExpressionSampleInformation-tc1819

人类基因表达样本信息数据集HumanGeneExpressionSampleInformation-tc1819

数据来源:互联网公开数据

标签:基因表达, RNA测序, 生物医学, 样本信息, 转录组学, 临床数据, 组学研究, 数据挖掘

数据概述: 该数据集包含来自基因表达研究的样本信息,记录了与人类基因表达相关的各种样本的详细信息,旨在为研究人员提供关于样本特征、实验设计和处理方法的全面理解。主要特征如下: 时间跨度:数据未明确标注时间范围,通常表示为特定研究或实验的样本集合。 地理范围:数据未明确标注地理范围,但样本可能来源于不同地区的医疗中心或研究机构。 数据维度:数据集包括多个关键字段,如样本标题(title)、GEO accession(geo_accession)、样本状态(status)、提交日期(submission_date)、更新日期(last_update_date)、样本类型(type)、通道数量(channel_count)、来源名称(source_name_ch1, source_name_ch2)、生物体(organism_ch1, organism_ch2)、样本特征(characteristics_ch1 - characteristics_ch1.10)、处理方案(treatment_protocol_ch1)、分子类型(molecule_ch1, molecule_ch2)、提取方案(extract_protocol_ch1, extract_protocol_ch2)、标记(label_ch1, label_ch2)、标记方案(label_protocol_ch1, label_protocol_ch2)、分类学ID(taxid_ch1, taxid_ch2)、杂交方案(hyb_protocol)、扫描方案(scan_protocol)、数据处理方法(data_processing)、平台ID(platform_id)、联系人信息(contact_name, contact_laboratory, contact_institute, contact_address, contact_city, contact_state, contact_zip/postal_code, contact_country)、补充文件(supplementary_file, supplementary_file.1)、数据行数(data_row_count)以及其他临床相关信息,如年龄、批次、BMI、疾病状态、胚胎植入相关信息、样本类型、吸烟史、活检时间、组织类型等。 数据格式:CSV格式,文件名为sample_info.csv,易于数据分析和处理。 来源信息:数据来源于公共基因表达数据库,如GEO数据库,已进行标准化处理。 该数据集适合用于基因表达研究、生物信息学分析和临床研究。

数据用途概述: 该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景: 研究与分析:适用于转录组学、生物信息学、基因表达调控、疾病机制研究等领域的研究,例如,分析不同条件下基因表达的变化,探索基因与环境的相互作用。 行业应用:可以为生物技术公司、制药公司提供数据支持,用于药物靶点发现、生物标志物筛选、疾病诊断等。 决策支持:支持临床研究中的样本选择、实验设计和结果解读,帮助科研人员更好地理解基因表达的生物学意义。 教育和培训:作为生物信息学、基因组学、生物统计学等课程的辅助材料,帮助学生和研究人员熟悉基因表达数据的分析流程和方法。 此数据集特别适合用于探索基因表达与疾病、环境、治疗等因素之间的关联,帮助用户深入理解生物学机制,并支持个性化医疗和精准医疗的发展。

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数据与资源

附加信息

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版本 1.0
最后更新 五月 12, 2025, 07:47 (UTC)
创建于 五月 12, 2025, 07:47 (UTC)
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