数据集概述
本数据集为中华菊头蝠基因组渐渗研究的转录组测序相关数据,包含研究中使用的脚本说明文件与数据压缩包,支持分析该物种不同亚种间的核DNA渐渗现象,可用于探究基因组渐渗与不完全谱系分选的共同作用机制。
文件详解
README_for_data and scripts.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Perl脚本使用说明,如
parse_results_from_tblastx.pl(处理tblastx结果生成文本文件)、extract_sequences_from_tblastx_results.pl(从结果中提取序列)等分析流程相关指令。
data and scripts.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包包含研究相关数据文件与分析脚本,具体内容需解压后查看,推测包含转录组测序原始或处理后数据、序列比对结果等。
数据来源
论文“Genomics of introgression in the Chinese horseshoe bat (Rhinolophus sinicus) revealed by transcriptome sequencing”
适用场景
- 基因组渐渗分析: 用于检测中华菊头蝠不同亚种间的核DNA渐渗事件,验证渐渗与不完全谱系分选的共存机制。
- 转录组数据挖掘: 基于测序数据开展基因表达、序列比对等相关生物信息学分析。
- 蝙蝠进化研究: 探究中华菊头蝠亚种的进化关系,分析基因组镶嵌结构的形成原因。
- 生物信息学脚本复用: 参考文件中的Perl脚本,复现或优化转录组数据处理与结果提取流程。