数据集概述
本数据集包含论文《Stomach as the target organ of Rickettsia heilongjiangensis infected C57BL/6 mice identified by click chemistry》所用的分析代码及数据文件,用于生成论文中的图表。数据集共13个文件,涵盖数据压缩包、Excel表格、R脚本、文本文件和制表符分隔文件等类型,支持对黑龙江立克次体感染小鼠胃部靶向机制的研究分析。
文件详解
- 数据文件(Data files)
- 文件名称:1a_Data.zip、4b_Data.xlsx、3c_Data.xlsx、2b_Data.xlsx、4a_Data.xlsx、4d_Data.xlsx、1d_data.txt、1e_Data.tsv
- 文件格式:ZIP、XLSX、TXT、TSV
- 字段映射介绍:包含实验数据,如1d_data.txt记录立克次体菌株信息;1e_Data.tsv包含Orthogroup(直系同源群)及各菌株对应数据列;XLSX文件为实验数据表格
- 代码文件(Code files)
- 文件名称:1e_UpSetR.R、1a_Circos.R、1d_barplot.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于生成论文图表的R脚本,如Circos图、UpSetR图、条形图的绘制代码
- 其他文件
- 文件类型分布:.xlsx占53.85%(7个)、.r占23.08%(3个)、.zip占7.69%(1个)、.txt占7.69%(1个)、.tsv占7.69%(1个)
数据来源
论文《Stomach as the target organ of Rickettsia heilongjiangensis infected C57BL/6 mice identified by click chemistry》
适用场景
- 立克次体感染靶向器官研究: 分析黑龙江立克次体感染C57BL/6小鼠后胃部作为靶向器官的机制
- 生物信息数据分析: 利用R脚本复现论文中的Circos图、UpSetR图等可视化结果
- 微生物基因组学研究: 通过1e_Data.tsv中的直系同源群数据,分析立克次体菌株的基因特征
- 实验数据验证与复现: 基于提供的原始数据和代码,复现论文中的实验结果和统计分析