RNA-Seq脑衰老及神经退行性疾病数据集
数据来源：互联网公开数据
标签：RNA-Seq,脑衰老,阿尔茨海默病,创伤性脑损伤,基因表达,基因分析,脑区分布,生物医学研究
数据概述：
本数据集包含从55名患有创伤性脑损伤（TBI）的受试者及其匹配对照组（总计107名受试者，经过质量控制）的海马、颞叶皮层和顶叶皮层（灰质和白质）中收集的377个RNA-Seq样本。数据集提供了受试者的元数据、神经病理学指标以及免疫组化（IHC）图像的量化结果。
RNA-Seq数据经过RSEM算法对齐和聚合并以基因水平进行标准化。数据集包含以下关键文件：
1. fpkm_table_unnormalized.csv：未标准化的FPKM值矩阵，记录每个基因在每个样本中的表达量。
2. fpkm_table_normalized.csv：标准化后的FPKM值矩阵，考虑了RNA完整性（RIN）和批次效应的影响。
3. columns-samples.csv：包含样本的详细信息，如样本ID、受试者ID、脑区分布、基因表达分析结果等。
4. rows-genes.csv：包含基因的详细信息，如基因ID、染色体、基因符号及名称等。
数据用途概述：
该数据集适用于研究脑衰老、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病）及创伤性脑损伤相关的基因表达模式。研究人员可利用此数据集探索特定脑区的基因表达变化，分析疾病机制，识别潜在的治疗靶点。数据集也适用于评估RNA完整性（RIN）和批次效应对基因表达的影响，为生物医学研究提供高质量的参考数据。此外，数据集可用于开发预测模型，帮助诊断和治疗相关疾病。
