数据集概述
本数据集为论文“Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth's RNA virome”的支持数据，包含海洋RNA病毒的系统发育树、序列比对文件、分类列表及映射文件等，用于分析全球海洋RNA病毒的分类修订、进化起源及生物地理分布，共8个文件。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：2022_README_Cryptic_and_abundant_marine_viruses_at_the_evolutionary_origins_of_Earth’s_RNA_virome_.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据背景、文件内容概述及使用指引
- 压缩文件
- 文件名称：Phylum_level_sequence_alignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含门水平的RNA病毒序列比对数据
- 文件名称：Global_RdRp_Phylogenetic_Tree.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含全球RNA依赖RNA聚合酶（RdRp）的系统发育树数据
- 文件名称：Class_level_sequences_and_alignments.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含纲水平的RNA病毒序列及比对数据
- 文件名称：Phylum_level_phylogenetic_trees.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含门水平的RNA病毒系统发育树数据
- 文件名称：Class_level_phylogenetic_trees.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含纲水平的RNA病毒系统发育树数据
- 表格文件
- 文件名称：Wainaina_et_al._2021_Mapping_file_for_sequences_used_in_the_global_RdRp_phylogenetic_tree.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：全球RdRp系统发育树所用序列的映射文件，关联序列与样本信息
- 文件名称：Wainaina_et_al_2021_Phyla_and_classes_list.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：RNA病毒门和纲水平的分类列表，包含新修订的分类单元信息
数据来源
论文“Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth's RNA virome”
适用场景
- 病毒分类学研究：利用门、纲水平的分类列表及系统发育树，修订RNA病毒的分类体系
- 病毒进化分析：通过RdRp系统发育树及序列比对数据，探究RNA病毒的进化起源与亲缘关系
- 海洋生物地理学研究：结合全球海洋样本数据，分析RNA病毒的地理分布模式与生态适应
- 病毒生态学模型构建：基于病毒丰度及分布数据，整合RNA病毒到海洋生态系统模型中
- 分子生物学研究：利用序列数据开展RNA病毒基因功能及分子进化分析
