RNA二级结构预测反应活性数据集RNASecondaryStructurePredictionReactivityDataset-liuxyz
数据来源:互联网公开数据
标签:RNA, 二级结构, 反应活性, 机器学习, 生物信息学, 序列分析, 深度学习, 数据建模
数据概述:
该数据集包含用于预测RNA二级结构的反应活性数据,记录了RNA序列在不同试剂下的反应活性值。主要特征如下:
时间跨度:数据未标明具体时间,可视为静态数据集。
地理范围:数据未限定具体地理范围,适用于RNA二级结构预测研究。
数据维度:包括RNA序列(sequence)和反应活性值(reactivity),其中reactivity分为两种,分别为2A3试剂下的反应活性(reactivity_2A3)和DMS试剂下的反应活性(reactivity_DMS)。
数据格式:提供CSV、H5、Parquet等多种格式,CSV文件包含序列和反应活性数据,H5文件可能包含训练好的模型,Parquet文件可能包含测试序列。
来源信息:数据来源于相关生物信息学研究或竞赛,用于训练和评估RNA二级结构预测模型。
该数据集适合用于RNA二级结构预测、机器学习模型训练和生物信息学研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于RNA二级结构预测、序列分析、生物信息学等领域的学术研究,如预测RNA分子的空间结构,研究RNA与蛋白质的相互作用等。
行业应用:为生物技术和制药行业提供数据支持,用于药物设计、基因表达调控等方面的研究。
决策支持:支持生物信息学研究和生物技术领域的决策制定,如优化药物设计流程,加速基因研究等。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习等相关课程的实训材料,帮助学生和研究人员深入理解RNA二级结构预测。
此数据集特别适合用于探索RNA序列与反应活性之间的关系,帮助用户构建和优化RNA二级结构预测模型,提升预测精度。