RNA二级结构预测竞赛数据集RNASecondaryStructurePredictionCompetitionDataset-kaushal2896
数据来源:互联网公开数据
标签:RNA, 二级结构, 序列分析, 深度学习, 生物信息学, 结构预测, 机器学习, 竞赛数据集
数据概述:
该数据集包含用于RNA二级结构预测竞赛的公开数据,记录了RNA序列及其对应的结构和反应活性数据。主要特征如下:
时间跨度:数据未标明具体时间,为静态数据集,适用于模型训练与评估。
地理范围:数据来源未明确标注,但可用于全球范围内的RNA二级结构预测研究。
数据维度:数据集包含训练集(train_data.csv)、测试集(test_data.csv)和提交格式文件(submission.csv)。
训练集包含RNA序列的ID、序列位置、序列本身、二级结构、预测的环类型、反应活性数据(包括reactivity、deg_Mg_pH10、deg_pH10、deg_Mg_50C、deg_50C)及其误差,以及多个时间步的序列、结构和预测环类型信息。
测试集包含与训练集相似的结构信息,但不包含反应活性数据。
提交文件定义了预测结果的格式。
数据格式:CSV格式,提供了清晰的表格数据结构,方便进行数据分析和模型构建。
来源信息:数据来源于相关竞赛,经过了预处理和结构化,可以直接用于模型训练和评估。
该数据集适用于RNA二级结构预测、深度学习模型训练、生物信息学研究等领域。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、计算生物学等领域的研究,如RNA结构预测算法的开发与优化、RNA功能研究等。
行业应用:可以为生物制药、基因工程等行业提供数据支持,特别是在RNA药物设计、基因表达调控等方向。
决策支持:支持RNA结构相关的生物学实验设计、结果分析和验证。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习等课程的实训材料,帮助学生和研究人员深入理解RNA结构预测方法。
此数据集特别适合用于探索RNA序列与二级结构之间的复杂关系,提升RNA二级结构预测的准确性和效率,并促进RNA生物学研究的发展。