RNA二级结构预测竞赛数据集RNASecondaryStructurePredictionCompetitionDataset-kaushal2896

RNA二级结构预测竞赛数据集RNASecondaryStructurePredictionCompetitionDataset-kaushal2896

数据来源:互联网公开数据

标签:RNA, 二级结构, 序列分析, 深度学习, 生物信息学, 结构预测, 机器学习, 竞赛数据集

数据概述: 该数据集包含用于RNA二级结构预测竞赛的公开数据,记录了RNA序列及其对应的结构和反应活性数据。主要特征如下: 时间跨度:数据未标明具体时间,为静态数据集,适用于模型训练与评估。 地理范围:数据来源未明确标注,但可用于全球范围内的RNA二级结构预测研究。 数据维度:数据集包含训练集(train_data.csv)、测试集(test_data.csv)和提交格式文件(submission.csv)。 训练集包含RNA序列的ID、序列位置、序列本身、二级结构、预测的环类型、反应活性数据(包括reactivity、deg_Mg_pH10、deg_pH10、deg_Mg_50C、deg_50C)及其误差,以及多个时间步的序列、结构和预测环类型信息。 测试集包含与训练集相似的结构信息,但不包含反应活性数据。 提交文件定义了预测结果的格式。 数据格式:CSV格式,提供了清晰的表格数据结构,方便进行数据分析和模型构建。 来源信息:数据来源于相关竞赛,经过了预处理和结构化,可以直接用于模型训练和评估。 该数据集适用于RNA二级结构预测、深度学习模型训练、生物信息学研究等领域。

数据用途概述: 该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景: 研究与分析:适用于生物信息学、计算生物学等领域的研究,如RNA结构预测算法的开发与优化、RNA功能研究等。 行业应用:可以为生物制药、基因工程等行业提供数据支持,特别是在RNA药物设计、基因表达调控等方向。 决策支持:支持RNA结构相关的生物学实验设计、结果分析和验证。 教育和培训:作为生物信息学、机器学习等课程的实训材料,帮助学生和研究人员深入理解RNA结构预测方法。 此数据集特别适合用于探索RNA序列与二级结构之间的复杂关系,提升RNA二级结构预测的准确性和效率,并促进RNA生物学研究的发展。

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数据与资源

附加信息

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版本 1.0
最后更新 五月 13, 2025, 23:45 (UTC)
创建于 五月 13, 2025, 23:44 (UTC)
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