RNA二级结构预测数据集RNASecondaryStructurePredictionDataset-yosukeyama
数据来源:互联网公开数据
标签:RNA, 二级结构, 生物信息学, 深度学习, 序列分析, 结构预测, 机器学习, 数据集
数据概述:
该数据集包含RNA二级结构预测相关数据,用于训练和评估RNA二级结构预测模型。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态数据集。
地理范围:数据来源未作具体限定,但适用于各类生物体内的RNA二级结构分析。
数据维度:数据集包括RNA序列、二级结构信息以及相关的预测特征。关键字段包括:id (序列标识符), id_seqpos (序列位置标识), sequence (RNA序列), structure (真实二级结构), predicted_loop_type (预测的环类型), bpps_sum, bpps_max, bpps_nb (碱基对概率相关指标)。此外,还包括多个子序列及其结构和预测结果(如b1_sequence, a1_structure等),以及对应的碱基对概率统计指标(如b1_bpps_sum, a1_bpps_max等)。
数据格式:提供CSV格式数据,包括aug_test_df_2.csv和aug_train_df_2.csv两个文件,方便数据分析和模型训练。
来源信息:数据来源未明确,但结构清晰,适合用于RNA二级结构预测相关研究。
该数据集适合用于RNA二级结构预测模型的开发与评估,以及深入研究RNA结构与功能的关系。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、计算生物学等领域的学术研究,例如RNA二级结构预测算法的优化、RNA结构与功能关系的探索。
行业应用:可以为生物技术公司、药物研发机构提供数据支持,用于RNA药物设计、基因表达调控等领域。
决策支持:支持生物信息学研究人员进行算法开发和模型评估,从而提升预测准确性。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习等相关课程的辅助材料,帮助学生和研究人员理解和实践RNA二级结构预测。
此数据集特别适合用于探索RNA二级结构预测模型的构建与优化,以及研究RNA结构对生物学功能的影响,从而加速相关领域的科研进展。