RNA二级结构预测训练数据集RNASecondaryStructurePredictionTrainingDataset-takoi55
数据来源:互联网公开数据
标签:RNA二级结构, 生物信息学, 序列分析, 机器学习, 结构预测, 深度学习, 序列比对, 数据挖掘
数据概述:
该数据集包含用于训练和评估RNA二级结构预测模型的数据,记录了RNA序列及其对应的预测结构信息。主要特征如下:
时间跨度:数据未标明具体时间,可视为静态结构预测训练集。
地理范围:数据未限定具体来源或生物体,适用于RNA二级结构预测的通用模型训练。
数据维度:包含以下字段:
id:RNA序列的唯一标识符;
sequence:RNA的核苷酸序列;
structure:RNA二级结构的预测结果,使用括号表示碱基配对,点表示未配对;
log_gamma:模型的对数伽马值,可能与预测置信度相关;
score:模型的预测评分;
cnt:可能代表序列中某种特征的计数;
predicted_loop_type:预测的RNA二级结构环类型,如发夹环(H)、茎(S)、内环(I)等。
数据格式:CSV格式,文件名为aug_data (2).csv,方便数据处理和分析。
该数据集适用于RNA二级结构预测模型的训练和评估,以及相关生物信息学研究。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学、计算生物学领域的研究,如RNA结构预测算法的开发与优化、RNA结构与功能的关系研究等。
行业应用:为生物技术公司和药物研发机构提供数据支持,用于RNA药物设计、基因表达调控研究等。
决策支持:支持生物信息学研究人员进行模型选择和评估,优化预测策略。
教育和培训:作为生物信息学、机器学习等相关课程的实训数据,帮助学生和研究人员理解RNA结构预测的基本原理和方法。
此数据集特别适合用于探索RNA序列与二级结构之间的复杂关系,以及评估不同预测算法的性能,帮助用户提升RNA结构预测的准确性和效率。