数据集概述
本数据集为Roie Dvir论文配套的在线表格，包含抑郁症相关的RNA-seq数据分析结果。通过解卷积批量RNA-seq数据，识别抑郁症状态、年龄、CRP水平等变量相关的显著基因，以及CD4+T细胞、NK细胞等细胞类型特异性的差异表达基因，共7个文件。
文件详解
- 全样本差异表达分析文件
- 文件名称：sig genes DEA thesis Roie Dvir.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含16类显著基因/转录本表格，覆盖抑郁症状态、年龄、CRP水平等变量的批量及下采样RNA-seq数据（66样本）分析结果，含FDR<0.1的显著基因/转录本信息
- 细胞类型特异性差异表达分析文件
- 文件名称：csDEG_sig_genes_CD4+_T_cells_Roie_Dvir.xlsx、csDEG_sig_genes_NK_cells_Roie_Dvir.xlsx、csDEG_sig_genes_myeloid_cells_Roie_Dvir.xlsx、csDEG_sig_genes_b_cells_Roie_Dvir.xlsx、csDEG_sig_genes_dn_T_gd_T_cells_Roie_Dvir.xlsx、csDEG_sig_genes_CD8+_T_cells_Roie_Dvir.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：按细胞类型分类，包含各细胞类型中抑郁症状态、年龄、CRP、BMI相关的显著基因表格（无显著基因则不包含对应测试结果）
数据来源
Roie Dvir的论文"Deconvoluting Bulk RNA-seq Data to Uncover Cell-Type Specific Signatures in Depression"
适用场景
- 抑郁症生物标志物研究: 分析抑郁症状态相关的显著基因，挖掘潜在诊断或预后生物标志物
- 细胞类型特异性机制研究: 探究CD4+T细胞、NK细胞等特定细胞类型在抑郁症中的基因表达变化
- 临床变量关联分析: 研究年龄、CRP水平、BMI等临床变量与基因表达的相关性
- 转录组数据解卷积验证: 验证批量RNA-seq数据解卷积方法在细胞类型特征识别中的有效性
- 精神疾病分子机制研究: 为抑郁症的分子病理机制研究提供基因表达层面的实证数据
