数据集概述
本数据集为2024年Romanenko、Peter和Kohn发表的研究配套数据，包含湖泊细菌多样性与人类肠道病毒灭活相关性的核心信息，涉及细菌物种丰度、样本元数据、分类学信息及病毒感染性与基因组衰减的原始测量数据，共4个文件，用于支撑湖泊细菌多样性对病毒灭活作用的研究。
文件详解
- 文件名称：species_table.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含不同样本中细菌物种的丰度数据，列名为样本条形码（如barcode4.05），行对应具体细菌物种的丰度值。
- 文件名称：metadata.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含样本标识符（sample.ID）、采样季节（season）、稀释度（dilution）、病毒感染性损失速率常数（k_i）、基因组衰减速率常数（k_g）及多种多样性指标（species_richness、Chao1、Shannon、InvSimpson）。
- 文件名称：taxonomy.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含species_table.csv中所列细菌物种的分类学信息。
- 文件名称：infectivity loss and genome decay.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含MPN法（感染性）和dPCR法（基因组衰减）的原始测量数据，以及96小时后的log10倍变化值、k_i和k_g数据。
数据来源
Romanenko, Peter and Kohn 2024的公开研究成果
适用场景
- 微生物生态学研究：分析湖泊细菌多样性与病毒灭活效率的相关性。
- 病毒学机制研究：探究细菌群落对人类肠道病毒感染性损失及基因组衰减的影响。
- 环境医学研究：评估自然水体中细菌多样性对公共卫生安全的潜在作用。
- 生物信息学分析：结合物种丰度、分类学数据与病毒动力学参数，开展多组学关联分析。
