数据集概述
本数据集包含溶瘤病毒(T22H07)和mRNA疫苗(M22H04)治疗小鼠肿瘤的单细胞RNA测序数据及原始代码,涵盖细胞材料、测序质控、细胞簇标记基因表达、CNV分析、细胞通讯基因对及免疫细胞表达谱等内容,为相关研究提供数据支持。
文件详解
- 质量控制与基础信息文件:
- Single-Cell RNA Sequencing Quality Control Criteria.xlsx:Excel格式,包含单细胞RNA测序质量控制标准
- CNV Score of TandNK and Cancer Cells.xlsx:Excel格式,记录T细胞、NK细胞及癌细胞的CNV评分
- 标记基因与细胞表达谱文件:
- Marker Gene Expressing Profiles for Main Cell Clusters.xlsx:Excel格式,主要细胞簇的标记基因表达谱
- Functional Gene Expression Levels (Matrix) of Tumor-infiltrating Neutrophils.xlsx:Excel格式,肿瘤浸润中性粒细胞的功能基因表达水平矩阵
- The Gene Expression Profile Matrix of Macrophages.xlsx:Excel格式,巨噬细胞的基因表达谱矩阵
- 处理组数据文件(TSV/MTX格式):
- PBS处理组:PBS treated tumor_barcodes.tsv(条形码)、PBS treated tumor_genes.tsv(基因)、PBS treated tumor_matrix.mtx(矩阵)
- T22H07处理组:T22H07 treated tumor_barcodes.tsv(条形码)、T22H07 treated tumor_genes.tsv(基因)、T22H07 treated tumor_matrix.mtx(矩阵)
- M22H04处理组:M22H04_ treated tumor_barcodes.tsv(条形码)、M22H04_ treated tumor_genes.tsv(基因)、M22H04_ treated tumor_matrix.mtx(矩阵)
适用场景
- 肿瘤免疫学研究:分析溶瘤病毒与mRNA疫苗治疗对肿瘤微环境的影响
- 免疫治疗机制研究:探究异源初免-加强策略克服肿瘤免疫抑制的分子机制
- 单细胞测序数据分析:验证单细胞RNA测序数据处理及细胞簇分析方法
- 癌症治疗药物研发:为溶瘤病毒与mRNA疫苗联合治疗的优化提供数据参考