数据集概述
本数据集为德国三种土壤中，干旱胁迫下玉米覆盖作物根系通道细菌群落的qPCR定量数据。通过SYBR® Green法qPCR检测16S rRNA基因拷贝数，使用大肠杆菌V3区域扩增子作标准品，样本设三次重复，记录反应条件及效率，包含元数据、原始数据及分析文件共27份。
文件详解
- 元数据文件
- 文件名称：20240416_metadata_RootWayS_2023.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含样本名称（Sample_Name）、样本标识（Identity）、处理变异（Variation）、变异编号（Variation_No）、来源（Source）、深度（Depth）、时间点（Timepoint）、地块（Plot）、覆盖作物类别（Cover_crop_category）、地点（Site）、年份（Year）、根系范围（Root-extent）、子项目（Subproject）、项目（Project）、处理条件（Condition）等样本元信息。
- 原始数据文件
- 文件名称：如20231213_DG_qPCR_16S_2023_RootWayS_KD_II_data.xls、20231213_DG_qPCR_16S_2023_RootWayS_KD_II.eds等
- 文件格式：XLS、EDS
- 字段映射介绍：记录qPCR实验原始数据，包括反应体系配置、循环阈值（Ct值）、熔解曲线数据等实验过程信息。
- 分析结果文件
- 文件名称：如20231218_DG_23_HS_analyses.xlsx、20231218_DG_23_HS_copy_number_qPCR.xlsx等
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含细菌16S rRNA基因拷贝数计算结果、样本间定量比较分析、不同处理组（如干旱胁迫、不同土壤类型）的细菌群落丰度统计等。
适用场景
- 土壤微生物生态学研究: 分析干旱胁迫下玉米覆盖作物根系通道细菌群落的丰度变化及土壤类型对其的影响。
- 农业生态系统微生物定量: 探究覆盖作物管理模式与土壤细菌群落数量的关联，为可持续农业实践提供数据支持。
- 干旱胁迫微生物响应机制: 研究不同土壤类型中细菌群落对干旱胁迫的定量响应，揭示微生物抗逆性规律。
- 土壤健康评价: 通过细菌群落丰度数据评估土壤生态系统的健康状态及恢复潜力。
