数据集概述
本数据集为Frictionless表格数据包格式，包含6个玫瑰品种、3个植物部位中61种已知代谢物的GC-MS检测数据，代谢物标注有CHEBI标识符和InChi，植物相关信息标注有NCBITaxId和植物本体标识符。数据源自2018年6月《Nature Genetics》发表的玫瑰基因组文章补充材料，用于展示FAIR数据标准及数据再分析应用。
文件详解
- 文件名称：rose-aroma-naturegenetics2018-treatment-group-mean-sem-report-datapackage.json
- 文件格式：JSON
- 字段映射介绍：包含profile、name、title、homepage、version、keywords、licenses、sources、contributors、maintainers、publishers、resources、missingValues等元数据字段，描述数据集基本信息与资源配置
- 文件名称：rose-aroma-naturegenetics2018-treatment-group-mean-sem-report-table-example.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含chemical_name（代谢物名称）、inchi（InChi编码）、chebi_identifier（CHEBI标识符）、var1_levels（变量1水平）、var1_uri（变量1URI）、var2_levels（变量2水平）、var2_uri（变量2URI）、treatment（处理组）、sample_size（样本量）、sample_mean（样本均值）、unit（单位）、sem（标准误）等检测数据字段
数据来源
Nature Genetics 2018年6月发表的玫瑰基因组文章（DOI: https://doi.org/10.1038/s41588-018-0110-3）
适用场景
- 植物代谢组学研究: 分析不同玫瑰品种、植物部位的代谢物组成与含量差异
- 玫瑰香气机制研究: 基于GC-MS检测的挥发性代谢物数据，探究玫瑰香气物质的合成与调控
- FAIR数据标准实践: 作为Frictionless表格数据包示例，用于生物数据标准化存储与共享的方法示范
- 代谢组学数据再分析: 结合Jupyter Notebook（关联GitHub项目）开展代谢物数据的二次挖掘与统计分析
- 植物基因功能验证: 关联玫瑰基因组数据，研究代谢物合成相关基因的功能与表达调控
