数据集概述
本数据集记录美洲犬蜱（Dermacentor variabilis）在冷休克恢复过程中的代谢组与转录组响应，通过联合组学方法探究其低温存活机制。包含差异基因表达、代谢物变化及甜菜碱等代谢物功能验证数据，涉及8个文件，覆盖原始组学数据、功能验证结果及转录组参考序列。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：ROSENDALE_2022__DATA_README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含标题、作者信息、数据生成时间等元数据
- 代谢组原始数据
- 文件名称：Raw_metabolite_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：蜱虫冷休克恢复过程中代谢物检测的原始数据
- 转录组原始数据
- 文件名称：Raw_gene_expression_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：蜱虫冷休克恢复过程中基因表达量的原始检测数据
- 转录组参考序列
- 文件名称：Dvariabilis_transcriptome_RCH_study.fa
- 文件格式：FA
- 字段映射介绍：美洲犬蜱转录组参考序列文件，用于基因表达分析的参考数据库
- qPCR验证数据
- 文件名称：Raw_qpcr_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：基因表达量的qPCR验证原始数据
- 存活实验数据
- 文件名称：Raw_data_RCH_survival.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：蜱虫冷休克恢复后的存活实验原始数据
- 甜菜碱功能验证数据
- 文件名称：Betaine_functional_validation_data.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：甜菜碱对蜱虫冷耐受性影响的功能验证数据
- 代谢物功能验证数据
- 文件名称：Metabolite_functional_validation_data.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Chemical（化学物质）、Concentration（浓度）、Survival（存活率）等字段的代谢物功能验证数据
数据来源
Mount St. Joseph University
适用场景
- 蜱虫低温适应机制研究: 分析冷休克恢复过程中基因表达与代谢物变化的关联，揭示存活分子机制
- 代谢组转录组联合分析: 整合组学数据，探究蜱虫低温响应的调控网络
- 抗寒代谢物功能验证: 基于甜菜碱等代谢物的验证数据，研究其对蜱虫冷耐受性的影响
- 生物信息参考数据: 利用转录组参考序列，支持蜱虫相关基因功能注释与表达分析
- 寄生虫生态适应性研究: 为蜱虫野外低温存活策略及地理分布研究提供分子数据支持
