数据集概述
本数据集为“Mutation Effect Prediction of Proteins using RoseTTAFold”研究提供支持,包含目标多序列比对(MSAs)、RoseTTAFold预测的蛋白质结构(PDBs)、实验值CSV文件及论文发表的预测结果,共4个文件,用于蛋白质突变效应的预测与分析。
文件详解
- Target_CSVs.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容介绍:压缩包,包含与目标相关的实验值CSV文件
- Target_MSAs.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容介绍:压缩包,包含目标多序列比对(MSAs)数据
- Results_mutation_effect_prediction_all.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Target Name(目标名称)、Input MSA Depth(输入MSA深度)、Baseline(基线值)、DeepSequence(Published)(已发表的DeepSequence结果)、MSA Transformer、Rfjoint no structural template、RFJoint with structural template、pLDDT of input structural template等字段
- Target_PDBs.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容介绍:压缩包,包含RoseTTAFold预测的蛋白质结构(PDBs)文件
数据来源
论文“Mutation Effect Prediction of Proteins using RoseTTAFold”
适用场景
- 蛋白质突变效应研究:分析不同方法对蛋白质突变效应的预测性能
- 生物信息学模型验证:验证RoseTTAFold等模型在蛋白质结构与功能预测中的应用效果
- 医学研究支持:为与蛋白质突变相关的疾病机制研究提供数据参考
- 蛋白质结构分析:基于预测的PDB结构数据,研究蛋白质结构与突变效应的关联